日本原子能机构计划在未来60～70年关闭日本89个核设施中的79个，包括研究堆和测试大楼。日本原子能机构估计，位于茨城县的东海乏燃料后处理厂的退役费用将达到71.9亿美元，如果加上处理高放废液的费用，最终费用将接近93.3亿美元。
日本原子能机构称“文殊”快堆的退役费用为14亿美元。不过，退役过程预计将持续30年，如果加上此间维护费用，“文殊”快堆的退役费用将增至35亿美元。
根据日本原子能机构新的预算计划，44个设施的退役工作将在2028财年同时开始。然而，日本原子能机构目前还没有针对核设施中库存钚的管理计划，也尚未决定如何处理79个核设施的放射性废物。
