作为国家生态文明试验区，发展清洁能源是海南自贸区的必然的选择。目前海南省已经在新能源产业上进行了相关布局。可借助自贸区建设、自身丰富的可再生能源、作为旅游胜地环境治理的必要性等实现氢能产业的快速发展。
目前海南汽车保有量约为113万辆，每年出入岛汽车约300万辆次，汽车尾气是海南岛大气主要污染源之一。2018年11月1日，海南禁止进口、销售、注册登记低于“国六标准”的车型，并于2030年禁售燃油车。在新能源汽车的全岛替代过程中，氢燃料电池大有用武之地。
2018年12月10日，交通运输部公布了《船舶大气污染物排放控制区实施方案》，海南省被划定为沿海重点排放控制区，并在2022年控制力度达到内河同一级别。要达到方案中的排放要求，海南省必须大力发展氢动力船舶。
此外，近期海南发布了《海南省大气污染防治条例》，对海南省燃煤和其他能源污染防治、工业污染防治、机动车船等污染防治作出了明确规定，目的是持续改善大气环境质量。氢能源作为清洁能源，在海南省能源结构调整中将起到重要作用。
海南发展氢能具有独特优势
1、国家对自贸区建设的资源倾斜。
海南自贸区的建设举世瞩目，国家将在其中投入大量资源。近期国内持续出台氢能的利好政策，若海南将氢能作为自贸区能源转型升级的重点发展方向，将获得国家的大力支持。
2、政策压力造就了巨大的新能源市场空间。
海南作为自贸区和旅游区，面临着巨大的环保政策压力：《船舶大气污染物排放控制区实施方案》将海南岛沿海领域作为排放控制区，且在2022年后海南控制区与内河达到同等级别要求;海南省政府承诺在2030年禁售燃油车，甚至早于大部分欧洲国家;《海南省大气污染防治条例》开始限制化石能源的使用。氢能源是海南省调节能源结构的一个重要选择，环保政策为海南的氢能源市场创造了巨大的空间，对培养海南本土的氢能源企业十分有利。
