在20世纪90年代以前，德国农村污水采取的是工业化集中式处理办法，即将污水通过排水管道输送到一个污水处理厂集中处理，但这样做除了成本很高以外，还带来污水处理之后的大量沉淀物和废物对环境造成的压力。进入21世纪以后，德国这种集中式处理办法正被分流式污水处理新办法所代替。具体如下：
1、分散市镇基础设施系统
在没有接入排水网的偏远农村建造先进的膜生物反应器，平时把雨水和污水分开收集，然后通过先进的膜生物反应器净化污水。这一系统不仅可以降低污水处理成本，还能在净化污水的过程中获得氮气，能达到使污水变成宝的目的，增强了农村土壤肥力。
2、湿地污水处理系统
湿地由介质层和湿地植物两大系统组成，利用这两大系统共同营造的生态系统，使污水处理功效达到最大化。该系统将农村生活污水通过水管道汇集流入沉淀池，经过沉淀池的4层筛选之后，再经湿地净化处理，然后达标排放或用于农田灌溉。系统运转不需要化学药剂，所有的材料都来源于大自然，对周边环境没有二次污染。湿地表面干燥，没有积水，构成景观绿地，日常运行费用很低，工艺流程简单，管理方便。
3、多样性污水分类处理系统
污水分为雨水、灰水和黑水，其中灰水指厨房、淋浴和洗衣等家政污水，黑水指经真空式马桶排放的厕所污水。居住区屋顶和硬质地面上的雨水被雨水管道收集，导入居住区内设置的渗水池。该渗水池属于小区的绿化设施，经过特殊的造型和环境设计，表面看起来就像景观设计的一部分，池底使用特殊材料如砾石等，使池中的水自然下渗并汇入地下水。
在暴雨或降水量大的情况下，还可以把多余的雨水导入相连的蓄水池，使雨水自然蒸发或通过沟渠汇入地表水。通过这种处理方式，雨水可下渗或者直接进入自然界的水循环。洗菜、洗碗、淋浴和洗衣等灰水，通过重力管道流入居住区内的植物净水设施进行净化处理。
