新能源汽车补贴指购置补贴，由相关部门直接发放给整车企业，而新能源公交车的运营单位可以享受补贴后的优惠价格。按照计划，这一方面的补贴到2020年底就将正式退出。但实际上，新能源公交车的运营单位还能享受一定的运营补贴。
2015年，多部委联合印发了《关于完善城市公交车成品油价格补助政策 加快新能源汽车推广应用的通知》。在《分配结果》中，运营补贴在此次下发的补助中占比达到一半，有超过76%的地区运营补贴超过了购置补贴。
虽然公交车的体量不如乘用车，但推行新能源汽车具有更重要的意义。与乘用车购置税地方补贴彻底取消不同的是，地方政府仍可继续对购置新能源公交车给予补贴支持。在补贴下降60%的背景下，中大型公交车基本无法如乘用车般通过配置的调整来优化到手补贴额。地补的存续可以有效缓解车企下半年压力。
此外，包括中央财政已经安排的2019年及以前年度燃油补贴结余资金，地方可收回统筹用于新能源公交车的运营。管理部门还将共同研究完善新能源公交车运营补贴政策，2020年起，将采取“以奖代补”的方式重点支持新能源公交车运营。
