当天会议部署整改审计查出的预算执行等问题，推动国家重大政策措施落地见效。此前，2016年度中央预算执行和其他财政收支审计结果已向社会公布。李克强明确要求各有关部门，要针对审计查出的政策不落实、资金使用不规范等问题，分门别类推进整改攻坚。
“政府要勇于揭示自己存在的问题，但更重要的是怎么解决这些问题。”总理说，“要把审计中发现的问题分解到各部门，限时按项逐条推进严肃整改！审计署要对整改结果进行跟踪督查！”
审计署负责人在汇报中介绍了审计中发现的一些具体问题。例如，至2017年3月底，电力安全培训机构资格认可、信息系统工程监理工程师资格认定等21项审批认证等事项未按要求取消下放；基本医疗保险定点零售药店资格审查等11项行政审批和中介服务事项下放或取消后，未能有效承接或监管未及时跟进。
“这些改革都是激发市场活力并获得社会广泛拥护的，也是经过反复论证、国务院常务会议讨论通过的，必须进一步加大工作力度，推动各项措施落地落实！”李克强强调。
也有一些审计发现的问题相对复杂。有关部门负责人汇报称，在营改增改革推进中，随着增值税可抵扣范围扩大，有的行业或企业出现增值税进项与销项税率“倒挂”，导致新增进项留抵税额超过销项税额，从而压占企业资金。
“这种问题本来不应该发生，但我们这么大的国家，要推进增值税改革，确实可能因为经验不足出现预想不到的问题。”总理说，“有关部门要按照‘问题导向’原则，抓紧研究出台相应措施，确保各行业税负只减不增！”
当天会议决定，要以整改为契机加快推进“放管服”和营改增等改革措施落地，抓紧落实化解过剩产能、脱贫攻坚、生态环保等方面的政策和项目。同时强化“三公”经费和扶贫、医保等民生领域资金管理，加强重点领域监管和风险防控，严防公共资金“跑偏”或沉淀。
李克强要求，有关部门不仅要下决心坚决纠正各种焦点问题、复杂问题，更要加大整改督查力度，对整改不力和不作为、乱作为的要严肃问责，坚决杜绝整改造假行为。
“如果问题确实比较复杂，需要更长时间整改，也一定要讲清楚原因。决不能没整改完说整改完了，结果是错上加错！”李克强加重语气说，“审计就是要动真的，我们整改的结果也一定要是真实的！”
按照规定，有关部门、单位和地方的整改结果要于10月底前报告国务院，并在向全国人大常委会报告后向社会公开。李克强最后强调，各地方、各部门负责人都要“把时间节点赶在前面”，限时办结各项整改工作。
